VBD: Construyendo un modelo simple para Zika

#zika #compartmental models #Spanish

El objetivo de esta práctica es presentar los conceptos básicos del modelado de Enfermedades Transmitidas por Vectores o VBD (por sus siglas en inglés Vector Borne Disease) mediante el uso del programa R, con énfasis en el funcionamiento de los métodos; utilizando como ejemplo un modelo básico de infección por arbovirus. En esta práctica, se comenzará por comprender los componentes que contribuyen a $R_0$ y cómo las posibles intervenciones influyen en la transmisión. ...

Visualización y Análisis de datos espaciales en salud pública

#spatial analysis #COVID19 #sf #clustering #Spanish

Introducción Este taller consiste en 3 partes que buscan exponer al alumno a múltiples técnicas de análisis espacial en el contexto de brotes epidemiológicos. Utilizaremos datos ficticios de la pandemia de COVID-19 en Lima metropolitana para aprender a manejar datos espaciales en ‘R’, visualizar múltiples formatos de datos espaciales y analizar la variación espacial del riesgo de COVID-19 incluyendo la detección de clústers (agrupaciones) de casos. Resultados del aprendizaje Al final de este taller, usted será capaz de: ...

Una introducción a R y RStudio

#R #Rstudio #Spanish

Introducción El presente tutorial es parte de los materiales de pre-curso “Curso corto sobre análisis y modelización de brotes para la salud pública.” El objetivo es presentar a los estudiantes los conceptos básicos de R y R Studio, con el fin de obtener algunos conocimientos básicos en la programación de R y R. Instalando R y R Studio R es un entorno de software libre y RStudio es un entorno gratuito y de código abierto para trabajar en R. ...

Taller R Markdown

#Reproducibilidad #R #R Markdown #Spanish

Inicio. Para comenzar, abra RStudio y cree un proyecto definiendo la carpeta de trabajo donde se van a colocar todos los archivos relacionados con esta práctica (ver figura 1). (Figura 1. Ruta para crear un proyecto) A continuación, siguiendo la ruta File>New File>R Markdown (figura 2) cree un archivo de R Markdown definiendo: título, autores y con formato de salida html. (Figura 2. Ruta para crear archivo .Rmd) Aparecerá en el panel superior izquierdo, un nuevo archivo con un encabezado delimitado por --- que incluye las definiciones anteriores más la fecha actual. ...